В декабре 1918 года в особняк четы Батюшкиных поселился адмирал Колчак. И с того самого момента этот дом стали называть неофициальной резиденцией Верховного правителя России. Здесь адмирал не только жил, но управлял вверенной ему территорией, а также руководил действиями Сибирской армии. Сюда с визитами прибывали дипломаты из разных стран.
Но также в этом доме было и совершено покушение на Колчака. 25 августа 1919 года прогремел взрыв, сильно повредив дом. Также было уничтожено караульное помещение. Сам Верховный Правитель не пострадал.
Но покидая особняк на Иртышской набережной в конце 1919 года, белый адмирал отправлялся на встречу смерти – в Иркутск.