Целебные свойства воды озеро широко стали известны только во второй половине XIX века. Говорят, первый научный отзыв об этом дал академик Паллас еще в XVIII веке. Для устроительства курорта на озере огромный вклад внес томский купец-золотопромышленник З. М. Цибульский.
По одной из легенд Цибульский обратил внимание на то, что его собака, случайно раненная им на охоте вблизи озера и оставленная местному жителю умирать, купаясь в озере, залечила свои раны и сама прибежала домой, обратно хозяину, при этом совершенно здоровой. Не поверив своим глазам, купец решил проверить на своем опыте, насколько целебна озерная вода. Цибульский начал лечить ваннами свой застарелый радикулит и, действительно, избавился от болезни.
Первые отдыхающие появились на Шире в 1873 году, когда местные жители поставили здесь юрты. А вот 1891 год считается основанием на озере первого в Енисейской губернии курорта. На берегу озера возник ряд курортно-медицинских учреждений, объединенных под названием «Курорт «Озеро Шира«».Рапу озера Шира используют для наружных бальнеопроцедур, как аналог морских купаний. Поэтому, на поездках к Мертвому морю можно сэкономить. Вместе со степным климатом и слабоминерализованными питьевыми водами озеро Шира представляет собой уникальнейший курортный комплекс в Восточной Сибири.
Минеральная озёрная вода аналогична Баталинской воде Кавказа. Она содержит концентрацию солей 17-20 г/литр.
С помощью минеральной воды и иловой грязи, добываемой со дна Ширы можно лечить:
заболевания органов пищеварения
заболевания периферической нервной системы
заболевания мочеполовой системы
гинекологические заболевания
заболевания костно-мышечной системы и соединительной ткани
болезни кожи
глаукома.