Парк находится в юго-западной части Республики Бурятия, на территории Тункинского административного района. На востоке и севере парк граничит с Иркутской областью, на западе и юго-западе — с Республикой Монголия, на юге ‑ с Закаменским районом Республики Бурятия.
Добраться до Тункинского национального парка можно на рейсовых автобусах или маршрутных такси из автовокзалов г. Иркутска, Слюдянки, Улан-Удэ до с. Кырен.